人类社会历史上曾大规模流行的各种传染病病原，由于在特定的空间和时间内形成巨大破坏，因此同时又是生物战争的最佳战剂。当前生物武器的分类方法有多种。根据生物学特性各种生物武器曾分为细菌性、病毒性、真菌性和毒素战剂四类。细菌性战剂包括炭疽芽孢杆菌、鼠疫耶尔森菌、土拉弗朗西斯菌、布氏杆菌、贝氏柯克斯体等，病毒性战剂包括天花病毒、东方马脑炎病毒、委内瑞拉马脑炎病毒、黄热病毒等，真茵生物战剂包括球孢子菌、荚膜组织胞浆菌等，毒素战剂包括肉毒毒素、蓖麻毒素、葡萄球菌肠毒素B等。尽管很多种病原微生物和毒素都可以引起人类疾病或中毒，但仅有极少数可作为生物战剂用于生物武器。
传染病学把传染病原分为四个危害等级。第一级危害群微生物：与人类成人健康和疾病无关；第二级危害群微生物：在人类所引起的疾病很少是严重的，而且通常有预防及治疗的方法；第三级危害群微生物：在人类可以引起严重或致死的疾病，可能有预防和治疗的方法；第四级危害群微生物：在人类可以引起严重或致死的疾病，但通常无预防和治疗的方法，如炭疽杆菌、霍乱弧菌、埃博拉病毒、天花病毒等。这些历史上对人类危害最大的病毒因此成为第一代生物武器的核心战剂。
一种来源于大自然的病毒或其它病原体要成为有效的生物武器，需要符合下述条件：一、可以方便地大量生产；二、在可施放量范围内可以造成人死亡或失能；三、传染性强(毒素除外)；四、产生合适大小粒子的气溶胶；五、易于播撒；六、易于生产、储存、武器化和施放后稳定、保持毒性；七、能够有效攻击敌方而已方掌握有效的防护手段。而近年来先后在两次重大疫病过程中袭击中国社会的非典病毒和新冠病毒，以及冠状病毒家族的其它致命性疫病病毒如中东呼吸症病毒，都具有成为新一代生物战剂的可能。而另一种引发埃博拉疫病的病毒，一旦被用作生物武器，则是人类历史上最危险的武器，更是人类某些人彻底道德沦落的表现。目前任何在战争中使用生物武器都是违反战争法的国际罪行，将遭受国际社会和受害国的最严厉追责。
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