新型冠状病毒2019-nCov（2020年2月12日被ICTV Coronaviridae研究组命名为SARS-CoV-2）引起严重的呼吸道疾病，并迅速在全球传播。截至2020年2月18日，中国报告了72436例确诊的COVID-19和1868例死亡人数。这些数字每天都会更新，而且预计还会进一步增加。这就迫切需要对致命疾病进行有效治疗。但是，当前的抗病毒药物对2019-nCov（SARS-CoV-2）的作用有限。尽管吉利德（Gilead）的NUC（核苷）抑制剂（以前无法治疗埃博拉病毒）似乎使美国华盛顿的2019-nCov（SARS-CoV-2）患者受益，但尚不清楚该药物是否会对其他患者有效抵抗病毒体。
研究人员对来自中国，美国和澳大利亚的19位患者的2019-nCov（SARS-CoV-2）RNA基因组的分析表明，这些病毒的序列存在差异（图1a）。这些差异主要是单核苷酸变异。图1b显示了一个单核苷酸变异的例子，该变异导致2019-nCov ORF8（SARS-CoV-2）的ORF8氨基酸62和84发生变化，这是一种与冠状病毒从蝙蝠向人类过渡有关的多肽。患者样本表明，2019-nCov（SARS-CoV-2）正在积极获得可能使其逃脱抗病毒药物的新突变。这对常规药物和疫苗的开发提出了严峻的挑战。
研究人员已使用CRISPR / Cas13d技术在实验室中实施了一种灵活高效的靶向RNA的方法，该系统可用于特异性靶向2019-nCov（SARS-CoV-2）RNA基因组，从而限制其繁殖能力。为了功能上破坏病毒，研究人员同时靶向ORF1ab和S的引导RNA（gRNA），它们代表病毒的复制转录酶（ORF1ab）和Spike蛋白（S）。吉利德的NUC抑制剂remdesivir具有与HIV逆转录酶抑制剂相似的化学结构，目前正在2019-nCov（SARS-CoV-2）的临床试验中进行测试。
CRISPR / Cas13d是一种RNA导向，靶向RNA的CRISPR系统。为了切割2019-nCov（SARS-CoV-2）RNA基因组，Cas13d蛋白和包含与病毒RNA基因组特异性互补的RNA。 CRISPR / Cas13d系统的一个优势是其在设计指导RNA方面的灵活性，因为Cas13d的RNA靶向切割活性不依赖于特定相邻序列的存在，例如DNA编辑效应子Cas9的NGG基序。系统的这一独特功能满足了快速开发指导RNA的要求，以靶向可进化并可能逃脱传统药物的不同病毒变体。
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