1999年8月，皇后区的医生们在一个周末里就遇到了8个病例。夏季接近尾声的时候，更多的病例出现。一些病人的发烧症状非常严重，以至瘫痪。截止到九月份，已有多名患者死亡。最初的检测指向了一种名为圣路易斯脑炎的病毒疾病，但后来的检测结果并不相符。
利普金和团队想方设法找来患者的脑组织式样反复观察研究，最终的分析结果让他大吃一惊，这种致病的病毒竟是骇人听闻的西尼罗病毒。他迅速将结果公之于众，指出这种疾病叫做西尼罗热，是一种人畜共患病，由携带西尼罗病毒的蚊虫叮咬人畜而引起发病。
预防西尼罗病毒感染最好的方法是减少和蚊子接触的机会，避免被蚊子叮咬。疾病流行期间更要大规模灭蚊以减少人类被感染的机会。
所以，当利普金的团队确定是西尼罗病毒后，美国迅速开展了有效的防蚊措施，阻止疾病进一步蔓延。
截至目前，利普金已经发现和鉴定包括沙粒病毒、博纳病毒、布尼亚病毒等超过500种与人类、野生动物和家禽疾病发生显著相关的病毒，并因此被誉为“病毒猎手”。
抗击非典的首批国际知名专家
2003年非典流行高峰期，利普金教授是应邀来到北京协助中国抗击SARS的首批国际知名专家。
2002年冬天，利普金教授得知中国南方出现了一种新的呼吸道疾病。当时大多数人认为那可能是流感的某个变种，但是后来他领导的团队发现这是一种冠状病毒，接着通过研究他们获得了一些关于这种病毒的基因序列的信息，并开发了一种实时检测方法。
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