NED与美国中央情报局有着千丝万缕的关系,董事局不少成员与中情局有联系。NED其中与两个子组织——NDI(US National Democratic Institute for International Affairs)、ACILS(American Center for International Labor Solidarity)更是一直在香港低调运作,向香港一些政治团体提供资助和培训。
NED曾在其网页对2003年阻挠香港《基本法》23条立法感到自豪,指受他们资助者参与组织“七·一”游行。
NED董事局不少成员与中情局关系密切,全面控制NED的财政。其中一名董事曾任负责情报研究的助理国务卿,在民主党执政期间,盛传是中情局局长热门人选。NED为掩人耳目,曾将大部分拨款通过非政府机构发放,但这些机构均与中情局有关。
另外,美国颠覆他国政权NGO组织还包括如美国索罗斯基金会这样的私人基金会。
现在,这些钱通过香港的地下钱庄或相关NGO组织,远远不断地向暴徒们流动。