审计还发现，社会建设专项资金存在挪用现象。昌平区天通苑北街道办事处和石景山区金顶街街道办事处，挪用社会建设项目经费13.55万元，用于公务用车加油卡充值和办公费等。
中央财经大学政府预算研究中心主任王雍君分析，审计结果揭示出专项转移支付中的许多重大问题，特别是补贴机制的缺陷、投入结构的不合理、采购管理中的漏洞和种种违规问题，都表明现行的专项转移支付体制需要作深度改革。“改革的大方向应是在强化透明与问责的基础上，逐步合并专项转移支付的类别并适当压缩其总规模，特别是应将投入挂钩转向产出挂钩的体制。这些改革将为系统提升公共支出质量作出重要贡献。”
