主体站房分为3层
重庆西站采取线上式布局，为特大型站房，建筑面积11。94万平方米。主体站房分3层：地下一层为出站层、地上一层为站台层、地上二层为高架候车层。从出站层进入重庆西站，目前站前广场施工基本完成，出站层的地砖、导向标识等都基本完成安装。出站层还专门设有平扶梯，方便旅客出站。
出站层的东侧为出站出口，西侧预留紧急疏散出口，设置有贯穿东西向的24米宽出站通道，换乘通道东侧连接东广场地下空间。东站房中部为出站厅，两侧设置售票厅（轨道交通）、设备用房和其他旅客服务等。
采用上进下出模式
顺着通道往上就是站台层，重庆西站规划设计29个站台面31条到发线，分别引入渝昆高铁、渝贵铁路。其中渝昆车场设置5台11线，渝贵车场设置6台12线。
中铁十二局介绍，重庆西站在2014年12月开工，采用上进下出的进出站模式，进站旅客可乘坐地铁、公交等交通工具通过东站房广厅或乘坐出租、旅游、社会车辆驶至南北落客平台直接进入候车大厅检票进站上车。
而下车的旅客可从站台通过南北两侧自动扶梯到达地下一层换乘通道，步行100-500米到换乘大厅，再转乘地铁、公交、长途、出租、旅游、社会车辆。
