车光铁委员在审议时说，从目前食用农产品质量安全管理情况来看，农产品质量安全法不仅未对食用农产品作出明确定义，监管标准也没有从安全性、营 养性等方面区分于其他农产品，极易导致在食品安全监管源头上出现薄弱环节。他建议，将食用农产品统一纳入食品安全监管范围。新法将“食用农产品”定义为 “供食用的源于农业的初级产品”，并规定：食用农产品的质量安全管理，遵守农产品质量安全法的规定，但是，食用农产品的市场销售、有关质量安全标准的制 定、有关安全信息的公布和本法对农业投入品作出规定的，应当遵守本法的规定。
实现食品安全可全程追溯，是社会各界一直呼吁的问题。“如何才能实现食品及食用农产品的全程追溯？实行批次管理是一个有效的解决办法。批次管理 是发达国家对包括食品在内的各类产品进行质量追溯和管理的通用的做法，我们理应加以借鉴。”在审议中，王明雯委员提出自己的建议。新法规定：国家建立食品 安全全程追溯制度。食品生产经营者应当依照本法的规定，建立食品安全追溯体系，保证食品可追溯。国家鼓励食品生产经营企业采用信息化手段采集、留存生产经 营信息，建立食品安全追溯体系。
“市场准入关，一定要把住。”刘振伟委员说，香港的蔬菜是内地供应过去的，但是香港的蔬菜是安全的，而我们内地的蔬菜不安全，差就差在检测上。 供港的蔬菜在产地是要进行检测的，到香港进入批发市场之前也要检测，不合格产品，不退回就地销毁。新法规定：食用农产品批发市场应当配备检验设备和人员， 或者委托食品检验机构，对进场销售的食用农产品抽样检验。进入市场销售的食用农产品在包装、运输等过程中使用保鲜剂、防腐剂等食品添加剂和包装材料，应当 符合食品安全国家标准。
对农药使用、婴儿配方奶粉、网购食品等社会广泛关注的问题，新法作出了回应
利用剧毒农药、化肥、膨大剂等对蔬菜瓜果进行病虫害防治、催肥，是百姓最担忧的食品安全问题之一。
“既然不能完全禁止使用剧毒、高毒农药，能不能采用标注的方式？一方面老百姓有知情权，另一方面对它的销售有影响，迫使加快科技进步，尽早淘汰 剧毒、高毒的农药。”在审议中，杨震委员这样建议。朱静芝委员则表示，剧毒农药如果继续允许使用，应规定剧毒、高毒农药不得用于蔬菜、瓜果、茶叶、中药材 和粮食作物。新法规定：国家对农药的使用实行严格的管理制度，加快淘汰剧毒、高毒、高残留农药，推动代替产品的研发和应用，鼓励使用高效低毒低残留农药。 禁止将剧毒、高毒农药用于蔬菜、瓜果、茶叶和中草药材等国家规定的农作物。
