总局数据显示，2017年水产制品的整体抽检合格率为98。1%。而据记者统计，在不合格水产及其制品中，孔雀石绿、硝基呋喃类药物代谢物为出现次数最多的不合格项目，超过九成的不合格水产品检出了国家标准规定“不得使用”或“不得检出”的氯霉素、孔雀石绿、呋喃西林或呋喃唑酮代谢物等。
统计显示，大部分涉“药物滥用”的水产品来自农贸市场、菜市场等，也有部分产品来自知名连锁超市。来自大润发江汉店的1批次黑鱼和1批次鳜鱼、永辉超市西安万达广场的1批次黑鱼，均被检出了孔雀石绿。广州天河区百佳超市的1批次黑鱼含呋喃西林代谢物，福州沃尔玛百货1批次对虾(大)检出呋喃唑酮代谢物等。
国家食药监总局曾表示，水产品检查中主要发现两个问题：一是鲜活水产品养殖过程中违规使用孔雀石绿、硝基呋喃等禁用药物的问题比较突出；二是违规使用禁用药物涉及多种鲜活水产品，不合格样品包括多宝鱼、黑鱼、鳜鱼、草鱼、鲈鱼、鲫鱼、明虾、基围虾等。
中山大学预防医学研究所副所长、公共卫生学院营养学系主任蒋卓勤认为，养殖密度大，加之一些水体受到污染，为减少鱼虾的死亡率、追求经济效益，一些不法商贩铤而走险使用违禁药物。这个过程中，监管难度很大，“一方面是主观故意投放药物，另一方面某些人饲养鸡鸭、畜类等滥用抗生素，这些动物的排泄物等也会污染周边的水环境。”
此外，北京工商大学食品学院教授曹雁平说，相关生产技术发展落后、成本高，也使得一些生产者，特别是小企业，采用了更廉价但不安全的方法解决问题。中国农业大学副教授朱毅则认为，水产养殖者和运输者如果能轻易买到这些化学产品，也很难从源头上加以控制。
