考古学界多年来一直寄希望于新疆地区能够发现旧石器时代遗址，自上世纪以来，新疆地区发现了大量的石器地点，但都未有明确的地层堆积。新疆吉木乃通天洞遗址是新疆地区发现的第一个具有明确地层的旧石器遗址，这对于新疆旧石器考古来说是开辟性的发现。
莫斯特文化作为旧石器中期文化的代表在欧洲、西亚等地有着广泛的发现，但中国的发现一直以来凤毛麟角，存在争议。通天洞遗址以明确的地层序列、风格鲜明的石器工业特征和严格的年代数据证明了旧石器中期文化的存在，勒瓦娄瓦类型的莫斯特文化在中国的西北边陲被学界一致确认，这对于中国旧石器考古来说是一个突破性的发现。
