在2006-2007赛季开始前，和慕尼黑1860队结束了租借合同的邵佳一转会到了德甲升班马科特布斯队，在主场对阵柏林赫塔队的比赛中，邵 佳一下半场射进了自己为科特布斯队的第一个进球，同时也是在邵佳一在德国联赛中的第10个进球。2006-2007赛季结束后，邵佳一帮助科特布斯队完成 了这个赛季保级的目标。
2007-2008赛季，邵佳一一直不受主帅桑德尔重用。但在新帅普拉什尼卡到来之际，邵佳一逆转颓势，争取主力位置，但是在联赛第8轮与法兰 克福比赛之前，邵佳一在训练中踝关节韧带撕裂错过新帅到来的首场比赛。伤情反反复复，邵佳一错过了大量比赛，直到2007年12月9日对阵汉堡的比赛中， 邵佳一时隔73天才重返赛场。
