2003年，邵佳一被德甲劲旅慕尼黑1860队相中，随即以100万欧元转会登陆德甲，成为杨晨之后，中国球员中第二名征战德甲联赛的。在 2002-2003赛季的德甲联赛中，慕尼黑1860对阵科特布斯的比赛中邵佳一面对主罚直接任意球得分，射进了自己在德甲联赛的第一个进球。
2003年8月，邵佳一在登陆德甲仅仅半年时，因左腿十字韧带和半月板受伤缺席大半个赛季的比赛，而慕尼黑1860队也遭到德甲降级至德乙。随 后的两个赛季，邵佳一随同慕尼黑1860队征战德乙，但是连续两年（2004-2005赛季和2005-2006赛季）未能升级回德甲。
科特布斯时期
