正如郭元晞所言，林凌教授是中国经济体制改革理论和实现形式研究的最早开拓者之一，也是中国城市经济理论和城市化道路研究的最早开拓者之一，并亲身参与和推动了中国的企业改革、城市改革、政府管理体制改革、市场经济活动试验、现代企业制度建设等实践进程。
林凌教授与蒋一苇向国务院提出在首钢进行大型国有企业改革试点的建议，在重庆进行中心城市综合改革试点的建议，与廖元和、刘世庆联合提出建立成渝经济区的建议及其他建议，得到中央和省领导采纳和实施。
改革者：
建言“南水北调”
研究成渝经济区发展
林凌教授这一生对西部大开发的研究，除建言“南水北调”外，还包括对成渝经济区发展思路的建议。
21世纪以来，林凌教授转向区域经济研究。1994年他在东南沿海7个省市作调查，写出《中国东南沿海经济起飞之路》一书，2000年他和中国工经联的同志考察了全国14个老工业城市，提交了《中国老工业基地振兴之路》的研究报告，2000年中央启动西部大开发之际撰写了《关于西部大开发战略的讨论》《审视西部大开发》和《中部崛起》等报告和文章，这些观点与2005年中央提出的区域发展总体战略不谋而合，对全国区域经济研究做出了贡献。
2005年以来，林凌教授牵头完成多项重大项目，包括重塑四川经济地理、成渝经济区发展思路研究、停建南水北调西线工程等，获中央和省部级领导的采纳。特别是他和刘宝珺院士、马怀新、刘世庆等50多位自然科学、社会科学家合作下，在省老科协指导下，花了12年时间出版了《南水北调西线工程备忘录》及增订版，获得国家领导人的高度重视。2008年国务院常务会议决定南水北调西线工程暂停；2016年国务院有关部门决定，改变原定西线方案，重新研究新的调水线路。
