关于收费问题，相关条例中明确规定，幼儿园不得收取书本费，不得推销或变相推销玩教具、图书等方式收费、不得以开办特长班、兴趣班等为名收取费用，更加不得收取或变相收取与入园相关的赞助费、捐资助学费等费用。
然而，变相收费依然存在。南京市环境监测中心站站长王合生代表此前调研发现，条例禁止的各种变相收费名目受到约束，但未例举的收费名目依然存在，比如“家长培训费”，各种兴趣班、延长班等。小托班流行，成为入园的基本条件之一。高价收费的小托班自然与入园的变相收费捆绑到了一起，“很多家长自愿缴费，但心里的抱怨却是无奈。”王合生说。
对上述问题，上海铁路局南京客运段段长、党委副书记杨光代表建议，主管部门加强对幼儿园保育教育费用的检查监督，不仅是公办幼儿园，民办幼儿园也要加强监管。
