这些声音其实与舱内温度变化有关。杨利伟驾驶的神舟五号载人飞船，由轨道舱、返回舱、推进舱和附加段组成，总长8.8米，总重7.8吨，以平均每90分钟绕地球1圈的速度飞行。飞船在微重力和稀薄大气环境中飞行的，每绕地球飞行一圈，船体就经历一次较大的温差变化，这要比地面上一昼夜温差变化剧烈的多，所以会造成船体微变形(又称蠕变)，引发飞船舱内外壁材料压力变化所致。
在温度变化的过程中， 舱室内的压力会随着温度的变化而变化，内外压差的变化导致舱体内壁材料发生一些形变，内外压差变大时，向外变形，减小时向内变形，从形成咚咚的响声， 听上去类似外面有木头锤子敲在舱上面的感觉。
虽然在太空中没空气，声音无法传播，但飞船舱内是有空气的，所以太空舱每天多次绕地球飞行的，其温差的变化非常惊人，太空舱部件形变发出的声音，只能在有空气的舱内传播，所以杨利伟在太空舱里面就会听到"咚咚咚"的响声。
神舟飞船的金属或非金属的结构和部件，由于热涨冷缩和压力变化，都会不同程度的发生形变，有些形变就会发出声响。受力金属结构遇到巨大载荷后会发出声音，这种情况在地面也很常见。
苏联BIOS-3实验室内部的隔舱。
尤其是北方寒冷的冬季，人们会发现房间的供暖系统在供热时会发出不规则的敲击声音，就是压力和温差导致管道或供暖系统部件微小形变发出的声音。另外在一些油库也会遇到这种情况，油库储存的桶装油，有时候在深夜都会有"咚咚咚"的响声，这是由于日夜温差造成油桶变形而发出的声音。
大型建筑的响声更明显，比如一座桥梁(特别是钢结构桥梁)遇上重载之后，也会发出咯吱的声音。钢结构建筑遇到气温突变，也会在热胀冷缩作用下发出响声。
