没建成的空军一号咱们先不说，就来说现在正在服役的这两架空军一号专机。空军一号之所以这么贵，主要是贵在了它上面安装了普通客机所没有的空中防御系统，而且这个防御系统经常要进行升级更新。就拿92-9000号空军一号专机来说，外界在2012年就发现其安装了5个可发射脉冲红外信号对抗热寻导弹的ALQ-204“斗牛士”干扰机。
此外空军一号还安装了其它尖端设备，包括安装在飞机尾部的AAR-54导弹告警系统，这个告警系统可探测并跟踪接近的威胁，并随时把数据提供给飞机上的两个AAQ-24“复仇女神”DIRCM定向红外对抗干扰机。可以说，想要用导弹击落空军一号专机真的是很难，强大的干扰可以确保空军一号不被任何导弹击落。
作为美国总统在天上的办公室，空军一号还具备强大的通讯能力，目的只有一个，那就是高效而又保密的与地面进行联络沟通。空军一号在之前被发现安装有轻型多功能保形天线，可用于各种卫星及其他通讯。美国空军甚至耗资5800万美元研制总统专用数据系统（PDS），以增强两架空军一号的带宽、卫星通信和视频会议能力。
