这时越军第一阶段作战结束，中国军事顾问团要求越军继续土工作业，利用战壕向法军步步推进，同时重炮阵地也往前移。炮口直接对准了机场，到28日，法军停止了飞机的降落，所有物资完全依赖空投了。这个时候，越军的高炮也拉上了山头，使法军不得不提高空投高度，这样空投的准确度下降了，很多物资都投到了越军的阵地上。
在中国军事顾问团的建议下，越军于30日发动每二阶段的进攻，主要目标是奠边府东部的高地群，越军的三个主力师在百门火炮的开路下，同时发起了进攻。312师以两个营进攻C1高地，一个营进攻D2高地，很快便得手。随后以一个连直插纵深，主力向D3高地进攻。D3高地的守军将火炮直射，还用火焰枪和机枪打出了一道火墙，同时还得到中心区炮兵的支援，部分越军的攻击部队又误入雷区，所以312师进攻受阻，而向纵深直插的一个连也给法军包围歼灭。
316师的进攻比较顺利，很快就拿下了A2。但在攻打A1高地的时候，由于法军A4高地比雅尔少校及时组织力量增援和A1高地守兵的顽强反抗，未能能占领该高地。法军经过一夜的激战，勉强顶住了越军的进攻，但老德心里很明白，现在防御区已门口大开，如此固守对法军来说非常不利。所以第二天他将预备队投入战斗，并任命比雅尔少校为这支部队的总指挥，夺回丢失的高地。
此后的几天里。两军在D2、A1和H6高地展开了激烈的争夺战，至4月2日，双方各占这三个高地的一半，进入了相峙状态。这时越312和308这两个主力师也大伤元气，无力再战。
老纳在此时也把他在印度支那的最后机动力量一个伞兵营和一个炮兵营空投到奠边府，并要求老德死守。可这时的老德面对着残酷的战争丧失了斗志，守军实际由朗德莱中校接管，比雅尔少校为其副手。
随后比雅尔带人夺回了东部高地群的核心阵地C1高地，越312师长得知C1失守以后，组织了一个团进行反攻，小比知道此阵地非同小可，也将最后的预备队4个伞兵营全部队投入到C1高地的战斗。老武一看也紧张了，只好将他手中的王牌308师的102团投入到战斗中去，这个团可是老武一直都不舍得用的，不过现在到了关键时候，也容不得老武考虑了。只可惜这102团中看不中用，战至12日清晨伤亡达700多人，失去了战斗力，而小比的伞兵只付出了87人的代价就守住了C1高地。
