2001年，“9·11事件”发生一个月后，美国又以打击基地组织为名，出兵并控制了阿富汗。和科索沃战争时一样，在美军的军事行动展开之前，中情局的人员即先行进驻，负责搜集情报，接洽反塔利班武装，收买线人，笼络地方部落首领。开战后，又为美军的空袭指引目标，并为地面行动提供信息。阿富汗战争结束后，据CIA的初步统计，他们共计花费了7000万美元(内含建立战地医院的费用)。
在一场现代化战争中，这个数字不过是2架俄制三代战斗机的价格，尚不及一架美制四代战斗机价格的1/3。所以，连小布什也不无得意地赞扬：“这实在是太便宜了。我真的很奇怪，前苏联在对阿富汗的战争中花了那么多钱，为什么到最后还是一败涂地？看来在这点上，他们没有我们聪明。”
与此同时，美国也意识到，中情局之类的机构不宜频频露面，所以，美国开始更多地借助NGO(非政府组织)，更加巧妙、间接地达成美国的国家战略意图。成立于1983年末的“美国国家民主基金会”(NED)就是此类机构中最著名的一个。用该基金会的创始人之一艾伦·温斯坦的话说：“我们今天做的许多事情，就是25年前中情局偷偷摸摸做过的事情。”
新的运作程序一般是先由美国战略决策层圈定与美国的国家安全与利益密切相关的国家和地区，然后对这些国家和地区的威胁度和重要性进行排序。随后，有针对性地锁定具体目标，利用当地的反政府势力，以民主化为旗帜，以人权斗争为手段，展开颠覆现政权的政治活动。中情局的工作是在幕后进行秘密策划与指导，并安排人力与资金的支持。关联性民间机构则在半公开地扶助当地的亲美派反政府势力。
其手段包括境外的电台、网络宣传，进入当地创办纸质期刊，以宗教组织、文化社团和论坛的形式延展其力量触角，组建培训性机构训练运动骨干，同时广泛发行所谓的“民主”指导手册，引导当地民众组织街头政治斗争和反政府行动。其手册内容从一般性的组织结构、运作方式，到统一服装的设计制作，再到活动地点、时机的选择，以及如何对国家暴力机器进行怀柔式渗透(如事先数年即开始向警察与驻军寄送精心准备的礼物包裹与宣传信件)，事无巨细，包罗万象。
继塞尔维亚之后第二个遭到美国策动的“颜色革命”毁灭的国家是格鲁吉亚。该国的重要性在于其独特的地理位置。波斯湾资源圈占据了世界石油已知储量的65%，里海资源圈则是全球第二或第三的潜在资源产出区。一个脱离了俄国势力范围的格鲁吉亚，使美国可以经阿塞拜疆、格鲁吉亚、土耳其，绕开俄罗斯直接将里海资源外输。这将进一步削弱俄罗斯的全球地位，并使美国与欧盟能够更便捷、更安全地获得里海资源，也将有效削弱俄罗斯对里海-波斯湾地区的影响。
