1966年2月，江青在部队文艺工作座谈会上点名批评了10余部电影，其中包括《地雷战》和《地道战》。王耀南深感事关重大，他向中共中央办公厅请求面见毛泽东陈述自己的意见。中共中央办公厅安排他和江青面谈，他在江青办公处据理力争：“《地雷战》、《地道战》影片是贯彻毛主席人民战争思想和《论持久战》的精神;这是抗日战争时期真实战例的汇编;影片是我自己组织指挥的，是工程兵部队和民兵进行训练的军事教材，不是故事片，与作家、演职人员没有关系。”
江青最后无可奈何地让了老将军一步，说到：“你们这些将军只晓得打仗，不懂得艺术。会议上我是批评有些影片的艺术水平差，线条太粗，才点了《地雷战》、《地道战》的名。”江青对总政的负责同志说：“既然王耀南同志再三强调这两部影片是军事教学片，那你们回把片头剪去，注明是军事教学片，继续放映。”当时敢对江青坦诚相争的将军为数不多，王耀南便是其中之一，可见其为人正直坦率。
1966年8月，审查《毛主席去安源》的油画时，对油画的图注是：“毛泽东1920年到安源”，并说毛主席在建党以前就曾去过安源做工人运动。王耀南当即提出异议：“毛主席1920年没有去过安源。1921年秋毛主席去的安源。”他认为应该实事求是。他在博物馆打电话请中共中央办公厅主任汪东兴到毛主席处核实。主席后来答复说：王耀南同志的回忆是正确的。
呕心沥血工兵王
1984年11月3日6时25分，王耀南彻底地离开了他钟爱的工程兵部队和事业。王耀南长期在工程兵部队和领导机关任职，在长期革命斗争的实践中积累了丰富的工兵知识和工作经验。他不仅为组建工程兵部队作出了重大贡献，还对工程兵部队的革命化和现代化建设作出了重大贡献。王耀南的一生是革命的一生，战斗的一生，全心全意为人民服务的一生。他对革命事业忠心耿耿，有坚强的党性和英勇奋战的优秀品质。他尊重领导，团结同志，爱护战士，晚年仍为“四化”建设而奋斗，受到部队广大指战员的爱戴。
王耀南一生堪为悲壮！他参加过毛泽东领导的秋收起义及随后的三湾改编，井冈山斗争、五次反围剿、二万五千里长征;从井冈山到抗美援朝他参加战斗达300余次，5次负重伤，却从不退却;1939年6月与日军川口遭遇战，他3次9处负伤，曾连续8次获得全军通令嘉奖，毛主席派江青持亲笔信前往慰问，信中称王耀南是“民族英雄”。江青代表毛主席把正面铸有“民族英雄”四个字的八路军战伤证章授予王耀南。
虽然他资格老，战功卓着，伤痕累累，可能因工兵是个辅助兵种，也可能因他文化较低，刚直暴烈，8次降职。1955年9月，授衔时他只是一名少将，但他获得二级八一勋章、一级独立自由勋章、一级解放勋章。特别是他在红军时期获得可终身免除死刑的二等红星奖章(中华苏维埃共和国政府规定终身免除死刑，现存军事博物馆)和红旗奖章，是他人难以相比的，是对他的最高奖赏和最高评价，也是对工兵(现工程兵)的最高肯定。
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