第二个重要的质疑是针对3栋坍塌的大楼。美国官方解释说，由于飞机的汽油燃烧，引起高温，最终导致坍塌。这个说法只能解释2栋世贸大楼，很难解释没有遭到飞机撞击的7号楼。即便接受大火燃烧的解释，编导举了一堆例子：1945年，帝国大厦79层误中炸弹，引起大火，大楼至今耸立；1975年，世贸大厦北塔3处起火，没有倒塌；
1988年，洛杉矶一栋63层高楼燃烧3个小时，火势从楼顶蔓延到4层，没有倒塌；1991年，费城一栋38层的大楼，燃烧19个小时，火势蔓延到8层，没有倒塌；2004年，委内瑞拉一栋56层高楼燃烧17个小时，火势蔓延26层，没有倒塌；2005年，马德里一栋32层高楼燃烧24小时，楼顶10层全部烧毁，掉了下来，但是整栋楼没有倒塌。
而110层的世贸大厦呢？一栋燃烧了近1个小时，在10秒钟之内完全坍塌。约半个小时后，另一栋燃烧了1个半小时不到，也在10秒之内坍塌。2栋楼的火势只蔓延了4层。傍晚，47层高的7号楼在6秒钟内坍塌。是否太类似、太雷同、太一模一样了？每一栋楼的坍塌都没有一丝一毫伤及周围楼群。
纪录片编导经过计算得出结论：大楼坍塌的速度几乎等于自由落体的速度。如果下层未着火部分稍微有所“顽抗”、“挣扎”，大楼全部坍塌的过程，应该经历更长一些的时间，很可能也不会完全垂直落下。但是，20万吨钢铁瞬间成为碎片。纪录片编导通过目击者证词、专家分析，录像带分析后认为：世贸双塔以及7号楼的坍塌，是一个精确的定向爆破。证据呢？
很多目击者、亲历者、逃生者、消防官员说，倒塌前他们听到大楼内部有自上而下一连串的爆炸声；抢救现场的通话录音显示，楼内多名消防员提到有爆炸，分别明确指出，爆炸发生在24、13-10、8-7层等，而此时大火在78层；通话录音还显示，消防员在大楼坍塌前提到，楼内有闪光；
远处有人看到坍塌前，大楼内部有连续闪光；坍塌录像慢镜头显示，逐步坍塌的下方，有原因不明的系列爆炸；负责世贸大楼保安工作的公司，属于小布什总统的四弟马文-布什，911事件以前，大约有两周时间，世贸大楼的保安取消了轮班守卫制度；世贸大楼坍塌后的残骸被运往海外……
