在这次搜查行动之前，俄罗斯外交部已对美方传出将搜查俄外交机构的消息做出强烈反应。俄外交部2日发布声明称，美方计划对俄罗斯驻美外交机构进行检查“是前所未有的侵略行动”，“美国特工部门可能借此机会通过偷偷在代表处放置有损(俄罗斯)名誉的资料，借以发起反俄挑衅行动”。当天，俄外交部召见了美国驻俄大使馆公使衔参赞，就此向其递交了抗议照会。
俄外交部声明称，“美国要在没有俄罗斯外交人员在场的情况下搜查俄驻华盛顿贸易代表处大楼，美国特勤人员要搜查俄驻旧金山总领馆，甚至连外交人员和家属的住所也不放过——这些都是极其危险的非法行径，是对俄罗斯的空前挑衅。”声明敦促美国立即停止这种“野蛮践踏国际法”“无视俄外交人员外交豁免权”的行为。声明还警告，莫斯科保留在互相对等原则基础上采取回应措施的权利。
对于为何要对俄外交机构进行搜查，美国国务院并未对此正式回应。不过，哥伦比亚广播公司引述一名国务院官员的话称：“这些搜查是为了确保和保护设施，并确认俄罗斯政府已经腾空了房舍。”他说，“俄政府的指责，包括美特工威胁要破门的说法是不真实的”。
