3.文化上的入侵。当天主教徒进入棉兰老岛生活时，他们企图将自己的宗教文化、生活习惯带到这个地区，并以此来影响这里的穆斯林，但整个地区的穆斯林人对此却十分恼火，或许是对于宗教的虔诚与敏感，天主教徒的这一举动，无疑加剧了两个不同信仰的人之间的仇恨。
杜特尔特
4.菲律宾政府的独裁、腐败。在赶跑了殖民者之后，马科斯在整个菲律宾实现自己的独裁统治，对整个穆斯林的一些反对情况和原因在不加思量的前提下，进行了血腥的镇压，造成了穆斯林人大量的死亡，结下了历史性的仇恨。加之整个菲律宾政府极度腐败，造成的压迫使穆斯林人的生活条件变得更差，引起了下层穆斯林的反抗。
5.经济问题。1997年亚洲的金融危机波及到了菲律宾，造成了财富的两极分化，大量人员的失业，无数家庭过着极为贫困的生活，就像约瑟夫·奈在《历史的教训》中写的那样，当反抗是死不反抗也是死的时候，许多人为了生存还是会选择反抗的，这是当时棉兰地区的状况，其实也是世界许多发展中国家面临的重要安全问题。
6.伊斯兰势力的崛起。从1979年伊朗伊斯兰教革命成功，建立了政教合一的伊斯兰国家，到2011年开始爆发的阿拉伯之春，再到现在的ISIS，他们的一个又一个的所谓的胜利其实无形中刺激了他们的这个“小兄弟”，让整个棉兰地区的穆斯林对于建立一个伊斯兰国家有了美好的憧憬和信心。
