第二次大败后，朱棣一路追，李景隆一路跑，一直从河北追到了山东济南，李景隆到了济南，留下了铁铉和盛庸把守，自己又跑了。济南之战在明史和其它如《明史记事本末》等资料中记载的差不多，但是和明实录不一样。明史记载的情况大致如下：1400年5月中旬朱棣包围济南，围攻了几天之后，燕军筑堤引水要水淹，铁铉一看不行，于5月17日让人出来对朱棣诈降说：“奸臣不忠，使大王冒霜露，为社稷忧。谁非高皇帝子？谁非高皇帝臣民？其又奚择焉！唯是东海之民，不习兵革，闻大军压境，将谓聚而歼旃，是失大王安天下、子元元之之意也。请大王退师十里，单骑入城，臣等具壶浆以迎。”——奸臣当道，大王你是对的，我们愿意投降，但是你要兵退十里，而且你要一个人来受降。
很奇怪，这么危险的事情，朱棣居然答应了，而且还真一个人来了；结果到了城门口要进城的时候，一块铁板照脑袋就砸下来了，朱棣反应快，没砸着，但马被砸死了，朱棣狼狈回营，又继续进攻济南。为什么呢？朱棣是一个非常精明的人，你翻翻历史，耍诈，用计谋，没人能玩儿得过朱棣，他怎么就这么容易被蒙住了呢？——从历史上看朱棣是一个非常爱面子（或者叫名节）的人，你看他跟朝廷军队打一仗，朱棣就给建文上一本：你说我的几条罪过，第1条实际情况如何如何，你是冤枉我；第2条实际情况如何如何，你是冤枉我...
他一直都在找机会洗白自己，想要得到认可，个人认为铁铉在诈降的时候，前面的那几句话起作用了“奸臣不忠，使大王冒霜露，为社稷忧。”这相当于认可朱棣的靖难行为啊，铁铉还是个文臣，可找到知音了——于是朱棣懞了，就来了。后来的一件事也能说明朱棣的这种心理，攻打南京的时候，李景隆打开了金川门把朱棣迎进来，朱棣把李景隆封为太子太师、左柱国——官员中的极品，导致很多靖难功臣都看不下去，他那意思就是：你是建文的臣子，你主动打开金川门代表你认可我的行为，认为我是对的，这比什么都重要，我要大大封赏你按理济南耍诈，还差点被砸死，这要搁一般人那得气疯了；得疯狂攻城，但是朱棣不是这样，铁铉把老朱的假牌位在城墙上一挂，朱棣就不敢打了。“是时燕兵势甚张，黄子澄等谋遣使议和以怠之。尚宝司丞李得成者，慷慨请行，见燕王城下。王不听，围益急。参政铁铉等百计御之。王射书城中谕降。贤宁作《周公辅成王论》，射城外。王悦其言，为缓攻。相持两月，卒溃去。”——《明史.高贤宁传》济南城里面把高贤宁的写的《周公辅成王论》射出城来，朱棣看到以后非常高兴——你看，把我看作周公啊，所以“为缓攻。相持两月，卒溃去”。
1401年（建文三年）5月，燕军粮道被袭（当时燕军防守的还是不错的，只是死了几百人），朱棣并没有主动去还击，而是派遣指挥武胜去南京直接给建文上书问责：这是什么意思啊，来议和的薛院长走了还没到10天呢，你们就来这个？要是这样明目张胆的耍诈，那我也就不能不动了（陛下虽有怜之之心而不能见则臣所以自救之计敢一日而忽之哉），如果朝廷还有诚意的话，就把平安盛庸他们的兵都罢了吧！建文接到到书奏应该是犹豫了一阵子，你看：跟朱棣打了这么久，一直都是提心吊胆的，两次倾国之兵发过去了，结果那么快就被打得落花流水；好不容易东昌胜了一回，结果没高兴几天又输了，打得过他吗？不如就答应他吧！——“帝将许之”（明史.卷141）。
关键时刻方孝孺出来说话了：“陛下果欲罢兵耶！即兵一罢散，不可复聚，彼长驱犯阙，何以御之？（明史纪事本末.卷16，说法同明实录）”——咱们征集来的兵马要是一散再想聚回来可就难了，要是兵马一散这小子杀过来怎么办？现在已经势如骑虎，下不来了，千万别被他的说辞迷惑了——个人感觉这块有点逻辑欺诈的味道，你召集来的兵马可以不必去出击，可以用来防卫京城啊。听完老方说的，建文下定了最后决心，为了表示自己的决绝——还做了一个很出格的举动，把武胜杀了（这是明史说法，明实录等的说法是把武胜下锦衣卫狱）。朱棣在大名巴巴的等了一个多月，在6月上旬终于收到消息，武胜被杀了。现在朱棣终于死心了。
结果，半个月后（6月下旬），朱棣也用同样的方法给朝廷来了个狠的，效果非常大，“乃遣都指挥李远等帅轻骑六千诣徐、沛，令易士卒甲冑，与南师同，插柳枝于背为识。远等至济宁谷亭，尽焚军兴以来储积。丘福、薛禄合兵攻济州，塞濠登陴，破其城，遂潜兵掠抄沙河，沛县，南军不之觉，粮船数万艘、粮数百万悉为所焚，军资器械俱为煨烬，河水尽热。”（明史纪事本末，此处记载大致同明实录）——不光把德州的储备军粮烧了个光，又把朝廷好不容易筹集到要运到前线的百万石粮食也干掉了。史载，京师大震。之后的事情大家都知道了，燕王南下，直破南京。
