中巴经济走廊规划的路线以及谁将受益于沿线建设的大型产业都是引发争议的议题。面积较小的俾路支省和开伯尔-普赫图赫瓦省(Khyber Pakhtunkhwa)的领导人称。
谢里夫迫使该高速公路穿过自己的家乡、本已是巴最富裕地区的旁遮普省(Punjab)，而非走一条更偏西、穿越穷得多的俾路支省和开伯尔-普赫图赫瓦省的路线。
中国在联合国安理会上维护了巴基斯坦
10月17日，在伊斯兰堡发表讲话时，孙卫东试图缓和巴基斯坦各省间的紧张关系。他说：“条条道路都将通向发展和繁荣。”他表示，巴基斯坦各地已有16个“早期收获”项目在建，总投资额达138亿美元。
中国还不得不周旋于巴军方与文官政府之间，两方在这两个问题上的紧张关系日益加剧，即由哪一方全面掌控中巴经济走廊工程，以及由哪一方负责领导为保护中国工程师而训练的1万多人的安全部队(由于巴方内部争吵，这支部队的部署已被推迟)。
印度总理纳伦德拉•莫迪(Narendra Modi)称巴基斯坦为“恐怖主义的母舰”
巴基斯坦已经在多个领域欠下中国的人情。在不久前于印度召开的金砖国家峰会上，印度总理纳伦德拉•莫迪(Narendra Modi)称巴基斯坦为“恐怖主义的母舰”，而中国是唯一为伊斯兰堡辩护的国家。
早些时候，中国在联合国安理会上维护了巴基斯坦，搁置将马苏德•爱资哈尔(Masood Azhar)列入联合国恐怖分子名单的请求。印度指控爱资哈尔领导的极端组织“穆罕默德军”(Jaish-e-Mohammad)发动了对印控克什米尔的恐怖袭击。
