除了想方设法要将台湾从中国分离出去的言行，令所有中国人难以接受外，李登辉浑身上下流露出的日本情结，也令人侧目。他对日本那种发自内心深处的认同感，先是令中国人愤怒，令日本人惊奇，现在，李登辉撇开美国抛出两国论，又轮到美国人对这位一笑就露出满口大板牙的人满腹狐疑了。
一位北京观察家指出：“李登辉曾到美国留学，总声称台湾体现了西方民主自由价值观，但实际上，那不过是因为现在只有美国才能做他的保护伞，是对美国实力的一种理智认同与利用罢了，他内心深处的情感归宿是日本，而不是美国。”
在海外早就流传着李登辉是日本人后代的说法。近些时间，这一说法在更大范围流传开来，北京《中国》发表的一位学者谈李登辉身世的文章中，提到了这种说法。而美国著名的《花花公子》则干脆在李登辉背上插上两面日本国旗，将他用作封面人物。
满门日本“忠烈”
当李登辉主政台湾之后，便有人查考李氏族谱，认定他是祖籍福建永定的客家人。李登辉本人1923年1月出生于台湾台北县三芝乡。
当时，台湾处于日本殖民统治之下。李登辉之父李金龙，毕业于警察官练习所，在日本殖民者手下充当刑警10余年，李登辉至今为此感到骄傲，说他是当时的“精英人物”。其兄李登钦曾在日军中服役，二战期间在菲律宾战场战死，其灵位至今仍摆在日本靖国神社。
