10月26日，杜特尔特与安倍举行会谈后共同会见记者。
日菲两位首脑继9月在老挝举行东盟峰会期间会谈后，此次为双方第二次会谈，也是杜特尔特任总统以来首次访日。今年也正值两国邦交正常化60周年。
杜特尔特：现在不是谈南海的时候
据日本共同社报道，日本首相安倍晋三26日在官邸与菲律宾总统杜特尔特举行会谈。围绕南海问题，双方就“法治”的重要性、基于国际法和平解决纷争和武力行使问题达成了一致。据悉，安倍可能以亚太地区的和平稳定需要美国的参与为由，向多次批评美国的杜特尔特呼吁采取灵活态度，修复美菲关系。
现在不是谈南海问题的时候
日本新闻网报道称，杜特尔特下午在与安倍晋三会谈时表示，现在不是谈南海问题的时候，菲律宾与中国的关系只是经济合作的关系，而不是军事同盟关系，希望日本政府能够安心。
会谈开始时，杜特尔特总统表示，南海问题希望在和平的背景之下予以解决，菲律宾必须与中国发展友好关系。他说，菲律宾在必要时会站在日本的一方，希望日本政府能够安心。
杜特尔特还表示，今天的会谈不愿意过多涉及南海问题，他说：“不是讨论南海问题的时候”，表示拒绝安倍希望菲律宾继续维持南海问题上原先立场的要求。安倍在会谈中称，希望发展日本与菲律宾的友好合作关系，也希望菲律宾能够遵循南海仲裁的立场，与日本加强在南海的防卫合作。
杜特尔特则称：“菲律宾与日本共享民主主义和法治价值观。我们将在‘和平解决’这一价值观下紧密合作”。他说，“我们追求和平，希望基于国际法和平解决”问题。
