因此，长期追踪研究黄金运台的吴兴镛先生提议台湾当局，用以部分运台剩余黄金的利息建立一个“中华世纪黄金教育基金”。他还声明，将其所著《黄金秘档》一书的全部稿酬捐献给这个基金，用以增进两岸交流、争取两岸和平。在他看来，这也是对大陆许多由于这笔巨金运台导致金圆券狂贬而受到损失的老百姓的一点象征性“补偿”。
大陆运台黄金主要用途：军费和发行新台币
吴兴镛在《黄金密档——1949年大陆黄金运台始末》一书中有详细的交代，这些黄金的主要用途有以下几方面：
1、作为发行新台币的准备金
根据吴兴镛在书中所引述的台湾大溪档案，1949年6月15日陈诚以“台湾省政府主席”的身份用80万两黄金和1000万美元做了2亿新台币的准备金。对此，袁颖生根据徐柏园的“政府迁台后之外汇管理初稿”所写的《光复前后的台湾经济》中有详细的描述：
“变售黄金以支应开支及以黄金折发军饷，主要系发生在民国三十八，九年（1949和1950年）。仅是黄金的变售价款，估计在此两年就分别有新台币超过1亿6千5五百万元（约60万两）及接近3亿9千4百万元（约140万两）。……此两年度省财政岁入分别不过1亿6百万元，及3亿8千7百万元，则变售黄金价款在1949年即高出年度省财政岁入的56.53%之巨，1950年仍略多1.86%，自为政府的巨额收入，而在省财政及‘中央财政’的岁入中，都未见列记……此200万两黄金数量与前五次公告之新台币发行之准备金（部分又被‘变卖’回收新台币）极相近。可能部分就是把‘央行’黄金（部分为‘财务署’保管的黄金）转给台湾银行发行新台币，大张旗鼓地公告，把超额发行的新台币用来作军饷，然后……静静地把部分黄金变卖，收回民间新台币，来防止通货膨胀，而在老百姓眼花缭乱之际，国民党迁台初期的财政经济就稳定下来了。”
也就是说，这批黄金对新台币的发行、稳定台湾金融市场以及抑制通过膨胀至关重要，如果没有这批运台黄金，国民党政府在赴台初期没有美援的情况下，恐怕根本无法在台湾立足。
2、军费支出
据吴兴镛介绍，除了1949年返回大陆100多万两黄金作为军政费用外，运抵台湾的黄金在1951年美国重新提供援助之前，主要用于支付60万军队的军饷、购买军需米粮、进口汽油零件及填补50%到100%的年预算赤字。
