但因为先正达在诸多方面拥有核心科技，上述并购案遭到了包括美国在内的少数发达经济体一些政治人物的“眼红”，声称这威胁到了美国的国家安全。商务部新闻发言人沈丹阳此前对此非议表示，中国化工集团收购美国先正达公司是国际投资并购中一起再正常不过的商业行为，某些政客总喜欢对中国的投资说三道四。
92岁的前化工部部长秦仲达反对中国化工收购先正达
正因先正达致力于转基因种子的发展以及对于农药化学品的研发，引起了中国诸多反转基因人士对这一并购案的反对。
质询书中提到，先正达是“世界第三大转基因种子公司，因推出第一代转基因作物而臭名昭著"，同时还称，“中化（编注：应该是“中国化工”）并购先正达，不难预见，那将使中国在转基因化工农业的垃圾陷阱里陷得更深，乃至再无法回头走出转基因化工农业万丈深渊！从而也将使中国人民的血汗钱永远滋养孟山都、先正达这些巨大的转基因毒瘤荼毒整个人类！”
“我是坚决反对的”，秦仲达称，“现在没有收购先正达，就已经侵害了中国人民的身体健康，它（转基因）是潜伏性的。我们吃了很多转基因的东西，我们都不知道，有的人根本不重视。”
据了解，除了秦仲达外，这些近460名的联名质询人中，排名前几位的多是年事已高的老人，且多不是相关领域的权威人士。
排在质询人第二位的是中国灾害防御协会灾害史研究专业委员会前顾问陈一文，其曾在崔永元的美国转基因调查纪录片中担任过顾问和翻译。
陈一文称，大家一直关注中国化工收购先正达的事情，也十分关注转基因的问题。但包括秦仲达在内的很多人此前对先正达这家公司也不是很了解，当时其研究整理了一些资料，还撰写了中英文方式公开信在网上发布，但效果并不好。后来，上述这封质询书是在杨晓陆（该质询文的联系人）提议下，由杨晓陆写了一个初稿，然后发很多人看，并提出意见。经反复修改后成文，后把全文打印出送给秦仲达过目。
