显而易见，日本在南海问题上的搅局，不仅无益于南海地区稳定与发展，反而将使南海问题更加复杂化，增加地区未来的不确定性。正如中国外交部发言人洪磊所说，作为南海问题上的域外国家，日本在南海问题上偏执地刷“存在感”，无非是刷出了日本在二战期间非法侵占中国南海岛礁的不良记录，刷出了日方当前在南海问题上的不良居心。
在南海问题上，日本最直接的动机是想在中日钓鱼岛争端以及东海油气田开发与划界问题上牵制中国。目前，日本重点拉拢菲律宾联合对华，支持菲律宾对南海仲裁案的立场和做法，暗自提供各种出谋划策，试图形成东海、南海两翼策应之势，在战略上对中国形成强大的压力，以此在钓鱼岛问题以及东海油气田开发与划界问题上为自己增加筹码，分散压力，牵制中国。因此，日本借南海问题渲染“中国威胁”而积极插手南海事务，已成为南海争端中至关重要的外部因素。
