南海地区的地缘战略极其重要，日本长期以来对该地区保持着高度关注。其实在二战期间，日本先后于1938年11月和1939年3月侵占了中国西沙群岛和南沙群岛的部分岛屿，以此作为推进其“南进战略”的重要基地。随后第二次世界大战的结束，日本结束了其在南海地区的一切统治，这最终在1951年9月由美国等主要西方国家和部分亚洲国家同日本签订的媾和条约——《旧金山和平条约》得以确认。
近年来，自美国奥巴马政府实施“亚太再平衡”战略以来，日本政府积极策应，将战略重心逐渐南移，在南海地区谋篇布局，成为了南海争端中一个至关重要的“搅局因素”。日本在南海争端中明显偏向和拉拢越南、菲律宾等东南亚一些声索国，积极与这些国家就南海问题展开对话和各种合作，将其视为在南海地区制衡中国的“重要伙伴”。
2013年7月，安倍晋三作为日本首相相隔七年访问了菲律宾。访问期间表明所谓对菲律宾外交原则（“四大倡议”），第一、共同建设有活力的经济，第二、加大海洋领域的合作，第三、加强对棉兰佬（Mindanao）和平进程的支援，第四、促进人员交流。同年12月，日本首次制定《国家安全保障战略》，将日本与中国的周边一些国家捆绑，指责中国“对日本以及周边国家坚持独自主张，试图以力量改变现状”，提出将采取实际行动要求中国克制，并构建相应框架等措施来控制不测事态的发生。
这样的表述明显是支持在南海地区与中国有领土争端的一些国家。可以看出，日本已明确在南海问题上选边站，并不认为是个“域外者”，将自己和南海其他争端国联系起来，塑造成一个共同遭受“中国威胁”的群体，明显站在中国的对立面。这一立场与美国在南海问题上表达的立场高度一致。
