王郁昭在若干年后谈到，他当时在会上听到中央领导人专门解释“批邓”的事情，非常感动，以至于当场流泪。
据赵树凯回忆，中纪委曾接到关于他的举报，举报的内容，也是上述“批邓”的问题。
1987年5月，中纪委派出工作组到安徽。调查组到合肥后，先与王郁昭见面并说明来意，王郁昭表示积极配合，照常工作。
1989年秋的一天，也就是调查结束两年多以后，中纪委约请王郁昭谈话。谈话就在中纪委所在地的一个会客室里，内容很简单。与他谈话的中纪委副书记说：“关于当年有人举报你的问题，我们早就查清楚了。但是，拖到现在才谈话，很是对不起。我们调查的结果，你没有问题，不需要做任何组织处理。谈话拖了两年，很对不起，向你表示道歉。”
晚年编辑《万里文选》
与万里讨论反腐败
1987年，王郁昭调任中央书记处农村政策研究室，而同年秋天十三大之后，万里基本上离开国务院，不再分管农村工作，于次年担任全国人大常委会委员长。
此后，王郁昭与万里的工作联系，主要是编辑农村工作重要文献选编和编辑万里文献。1993年夏天，中央政治局常委会决定编辑出版《万里文选》。经时任政治局常委李瑞环协调安排，王郁昭担任编辑组副组长。
王郁昭调任北京后，王郁昭时常会去探望万里。赵树凯曾回忆，有一次，王郁昭探望万里回来的路上，我问谈什么了，他说：“也没有谈什么，就是闲聊，谈到反腐败。万里说，现在的问题是反腐败部门本身也腐败”。
据媒体报道，2004年，安徽小岗村大包干纪念馆奠基，此时已退休的万里，给自己立下了“不问事、不管事、不惹事”的“三不”规矩。为邀请万里为纪念馆题写馆名，王郁昭去了万里家里，对万里说：“这个题词你要写，你不写谁写？只能由你来写，别人写都不合适。”万里听了王郁昭的话，说：“好吧。”让秘书拿了一张白纸，再找了一块硬纸板垫在腿上，坐在沙发上，写了“大包干纪念馆”几个字。
