即便如此，菲律宾政府仍然违背《南海各方行为宣言》，没有实质性地履行和穷尽《宣言》所载明的对话和磋商的原则，人为地恶化了中菲两国关系，也推高了两国在南海原本简单的主权与海洋权益争议。
菲律宾将南海争议提起国际司法诉讼，颇有心计地利用了三个有利因素。一是阵容强大、堪称豪华的国际律师和知名海洋法专家团队。二是让菲律宾充当"弱者"来博得同情和支持。三是随着中国崛起，美国、日本等西方国家出于"制衡中国"的战略目的而让菲律宾得到了大国权力对抗、小国"有缝可钻"的权力资源。
南海仲裁案的裁决结果很可能明显"偏袒"菲律宾。即将出台的仲裁决定，很可能包括以下几个方面的内容：
首先，裁决中国的南海九段线和相应的"历史性权利"诉求缺乏国际海洋法依据，而不是简单地判定南海九段线"不合法"。这相当于表明仲裁庭完全无视中国南海主权与权益主张的历史来源。
其次，裁决中国在南海实占岛礁的海洋法属性。裁定要么只有500米安全区、要么只有12海里领海，无法主张200海里专属经济区。对于客观上是符合《公约》121条规定、具有完整的"岛"的海洋法特征、可以划设200海里专属经济区的太平岛似乎难以做出裁决。
第三，如果仲裁庭不就黄岩岛的海洋法属性做出符合事实的判决，很可能将美济礁和仁爱礁定为菲律宾专属经济区内的海地地区，中国在美济礁的岛礁建设和对仁爱礁的主权要求将属"非法"。
最后，裁决中国在争端解决之前，应该停止拦截和驱赶菲律宾在南沙群岛水域的捕鱼和执法行动，包括中国应该停止在黄岩岛海域阻止菲渔民享有专属经济区的行动。
如果裁决果真如此，这一国际司法裁决将深化国际海洋法原则与其是否能有效适用的矛盾，并将加剧国际海洋法在全球司法实践的冲突性。其结果，要么是海洋法的国际司法实践需要更新进步，要么是《公约》的法律体系急需补充、修订和发展。否则，中菲南海诉讼案就将成为1996年《联合国海洋法公约》生效以来最大的败笔。
