新加坡《海峡时报》认为，似乎北京和雅加达都不愿意局势失控。对印尼来说，他们希望外资和经济援助刺激本国疲软的经济，而北京在资金技术及设施方面的援助对印尼无疑有帮助。《海峡时报》称，佐科之前，印尼与中国在纳土纳也有海上渔业争端问题，但是双方都淡化分歧、低调处理。佐科当上总统以及苏西上任渔业部长之后，雅加达对类似的争端容忍度降低，将事件公开化了。与此同时，纳土纳的渔业争端导致印尼反华情绪抬头，特别是那些反对佐科的群体。
印尼海军射击中国渔船
中国社科院亚太与全球战略研究院亚太文化研究室主任许利平在接受记者采访时表示，对于佐科视察纳土纳群岛，西方媒体的表现似乎是在南海问题上发现了新大陆，然后拼命煽风点火。事实上，中国从来没有主张纳土纳是中国的，也曾非常清晰、完整地表明过自己的态度。而印尼有些人，在西方炒作下，认为中国对纳土纳有领土野心。这一点，印尼政府是清楚的。但因为印尼民主化改革，很多内阁部长、民众不一定清楚来龙去脉，所以引起误读。
事实上对于纳土纳群岛的主权归属，中国一直并没有任何异议，并承认印尼对纳土纳群岛的主权，但由于中国主张的九段线与该群岛北部专属区有重叠的部分，两国围绕专属区的争议也是频频不断，加上纳土纳群岛附近海域拥有丰富的油气资源和良好的渔场，印尼对中国在该区域的活动非常警惕。面对中国在该区域的活动日益增加，印尼为了确保纳土纳群岛的安全，加强了对该群岛的军事部署，准备用武力捍卫自身的利益。
