得知中俄军舰驶入毗连区后，外务事务次官斋木昭隆与相关负责人齐聚外务省，立即向中国政府提出抗议。
斋木还表示，应该区别对待中国的此类行动和俄罗斯的行动，对俄不会提出抗议，理由是俄没有单方面对钓鱼岛提出领土主权主张 。
中国054级护卫舰首舰525号驶入钓鱼岛海域
鉴于中国战舰驶入钓鱼岛海域，安倍晋三首相称相关省厅要紧密合作加以应对，以防不测事态。报到称，鉴于中国军舰驶入钓鱼岛周边的毗连区，安倍晋三首相做出了以下三点指示：
相关省厅要紧密合 作加以应对，以防不测事态;
求与美国为首的相关国家开展紧密合作;
竭尽全力进行警戒监视。
日本护卫舰“濑雾”号
首相官邸的危机管控中心设置了情报联络室。防卫省紧急召开负责人会议。
防卫相中谷元9日上午指出，中国军舰此次进入钓鱼岛周边毗连区“有可能是为了展示绝不妥协的姿态。此举令人严重担忧”。
据日媒6月9日报道称，鉴于中国和俄罗斯的军舰驶入钓鱼岛附近日本领海外侧的毗连区，日本政府正以在首相官邸设置的情报联络室为主，加紧就中俄的意图以及两国是否开展了联合行动进行分析。
防卫省正与美军合作追踪中国军舰的动向，提高了警戒。
日本寻求加强与美军合作
报道称，防卫相中谷元对媒体强调：“防卫省和自卫队将继续冷静处理，避免无谓地使事态升级，同时坚决扞卫我国的领土、领海和领空，毅然决然地应对。”
对于此次事件，普京前不久来华即提出了对双方军方行动的具体诉求。
普京曝对钓鱼岛态度：日本得小心了
