她说，这次台湾地区的“政党轮替”和过去不一样，交接期长达4个月，要确保任务移转顺利过渡，也希望建立“交接制度”，让这次或以后交接有制度可以追寻，也必须共同稳定政局，让交接期间台湾地区的政局稳定。
她又称，选举时有议题攻防，有政治考量，但民众期待政治领袖可以坐下来，一起心平气和解决社会面对的重要问题。不管过去政党竞争多激烈，总是要努力让人民看见政党有合作可能。
双方随后闭门会谈70多分钟，触及年金、外交、教育、南海、能源等议题。马希望正派外交能持续下去，至于是否触及未来蔡出席巴拿马运河扩建竣工典礼等，与会的总统府副秘书长萧旭岑仅表示马英九总统在会谈中“提到若干邦交国的情况”，但因涉及机密不宜转述。
至于南海议题，据转述马向蔡强调在太平岛议题上未与中国大陆合作，并希望民进党在太平岛议题上不能缺席；蔡则指民进党对主权的主张没有改变，盼马勿误判。
蔡：碳排放是重大挑战
能源议题部分，马英九总统提醒未来限电与高电价风险必须考虑，并当场做了相关计算，说明民进党可能遭遇的困难；蔡则回应，智库已设算未来电力需求，强调目前核能问题，主要是核废料束手无策，未来会改善用电与发电效率，及调整经济产业结构，她也坦言，目前碳排放对台湾是重大挑战。
吴钊燮会后转述表示，结束闭门会谈后，蔡英文提到过去都是在公开场合和马英九总统互动，这是第一次闭门会谈，她很高兴有机会和马英九总统就重大议题共同讨论。
