然而2008年以来，美国首款第5代隐形战斗机F-22配备机载制氧系统后，共发生超过20起因设备异常而引起的飞行员缺氧事件。
美军一直试图弄清原因，但至今仍未能破解，所以只是通过增加机载制氧系统发生故障时启用的备用氧气来应对。
报道称，在此次日本航空自卫队的坠毁事故中，F-35A的飞行员通知地面“将中止训练”不久后便坠毁。似乎是飞行员在意识到出现某些异常后，状况迅速恶化，乃至最终坠毁。假设是机载制氧系统出现故障引起缺氧，则很符合这种情况。
坠毁事故后，日本航空自卫队的F-35A全部停飞。不过，如果日本想自主改进，比如拆掉F-35A的机载制氧系统、安装F-15的液氧容器等，按照与美方约定是不被允许的。
