再次，移交过程中可能会出现一些不确定因素。近年来，韩美就战时作战指挥权移交准备阶段、时间节点、移交后韩军主导的联合指挥体制，以及未来韩美联合司令部构成等，进行多轮协商。2018年10月，韩美第50次安保协商会议签署《韩美防卫合作指针》，重点解决“美军向韩军移交战时作战指挥权后两国联合防御机制运转”问题。
韩美决定未来韩美联合司令部司令由一名韩军上将担任、副司令由一名美军上将担任，联合参谋部本部议长不兼任韩美联合司令部司令。这可能导致韩军隶属关系、韩美指挥关系出现重大调整，并增加新的复杂因素。
需要指出的是，移交战时作战指挥权后，将形成“韩军主导—美军支援”的联合指挥结构。从以往情况看，美军也曾放手让韩军独立遂行相关演习任务，但由于暴露出的各种问题，演习很快回归“美主韩从”指挥模式。考虑到半岛未来可能出现的各种复杂情况，韩军能否主导联合作战指挥还是未竟之数。此外，韩国保守势力与进步势力在收回战时作战指挥权问题上意见不一，未来韩国哪种势力上台执政，也将对这一进程产生重要影响。
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