斯里兰卡爆炸事件发生后，中国科学院、广东省委省政府、广州市委市政府、中国科学院广州分院和中科院南海海洋所高度重视，立即成立应急协调小组，开展相关救援处置工作。中科院南海海洋所立即派出赴斯应急小组，并于八小时内抵达。当局在国家相关部门、驻斯里兰卡大使馆和斯方帮助下，全力寻找失联人员和救治伤员，第一时间将相关情况告知家属和相关单位；同时加强安全防范，确保科考船上人员和“实验3”安全。
4月23日，中科院南海海洋所3名受伤人员回到广州南方医院接受治疗，目前手术已完成，恢复情况良好，正接受后续心理治疗；其余七名未受伤的在斯工作人员，在积极参与了救援及寻找失联人员之后，分别于25日和26日分两批回到中科院南海海洋所，已分别接受心理疏导。同时，中科院南海海洋所于24日和25日分别派两个工作小组陪同家属赴斯开展辨认和善后事宜，并已安排医生对中国国内家属开展心理疏导。
斯里兰卡爆炸事件过程中，“实验3”及全船71人处于安全状态，靠泊正常。事件发生后，“实验3”取消了人员轮换和下船许可，并在完成补给后，于当地时间4月23日帮傍晚5时30分离开科伦坡港，将在完成海上科学考察任务后尽快回中国
