在作战使用上，俄海军可能将利用“海神”核动力无人潜航器的高机动、无限航程和高隐蔽性的性能优势，通过远程水下机动隐蔽前出部署至美国近岸有关海域或其他关键水域，使用所装载的相应任务模块，遂行战略核打击、反航母、反潜、布雷和支援保障等任务。
因此，基于超大尺度与核动力的平台优势，“海神”本质上是一种能够使用多种武器或传感器、作战使用高度灵活的察打一体型多任务水下无人作战平台。
从满足任务需求和当前无人系统自主技术以及人工智能技术的快速发展势头来看，“海神”核动力无人潜航器将具有人工智能和高度的自主任务能力。在技术储备上，俄已在最新的“物理学家-1”鱼雷上实现一定的人工智能，“海神”可在此基础上进一步发展。媒体也报道，“海神”核动力无人潜航器是一种具有人工智能、可在既定环境下独立行动的通用型全自主水下机器人，其导航系统可“在无任何外部修正下以足够高的精度快速接近目标或抵达任务海区”。
此外，俄军还可通过发送关键指令信息对“海神”进行远程指挥控制，如变更任务区域、取消攻击或改变目标等，以确保其处于己方指挥体系的有效控制下。向“海神”发送外部指令信息的方式可能有两种：一种是水声通信发送，如由“状态-6”系统框架下作为专用指挥平台和回收打捞平台的打捞搜救拖船承担；另一种是使用对潜长波通信发送。
