张启发和国内同行科学家提出了RICE2020计划，提出通过国内外合作，到2020年基本弄清水稻基因组全部基因的功能，并将研究成果及时应用于作物遗传改良，获得国内外同行的积极响应和国家有关部门的高度关注。…… 培育的转基因抗虫杂交稻在湖北省生产性试验，全生育期可基本不打农药……
12次担任在美国、法国、菲律宾、日本、韩国、中国等地召开的国际会议大会组委会委员。他领衔我国11个育种单位科学家参与了“全球水稻分子育种计划”，还牵头组织了作物遗传改良国家重点实验室与英国洛桑实验室、美国亚里桑那大学、美国密苏里丹佛研究中心等国际著名学术机构建立双边合作关系。
他还积极参加国际科技咨询活动，担任过美国麦克奈特基金会作物科学国际合作计划专家委员会委员，美国洛克菲勒基金会水稻生物技术国际合作计划科学顾问委员会委员，国际农业磋商组织“丰收计划”顾问委员会委员，国际科学基金（IFS）科学顾问，亚洲水稻生物技术指导委员会主席，德国科学基金会杂种优势研究重大项目专家评审组成员等，
2007年5月1日，张启发院士在华盛顿被宣布当选美国科学院外籍院士，成为中国大陆的8名美国科学院外籍院士之一，也是大陆高校目前唯一的一名美国科学院外籍院士。在谈及当选理由时，美国国家科学院在发表的声明中说：“他在自己的研究领域内取得了卓越的、持续的成就。”
