2001年，陈进回到中国，任教于上海交通大学。同时他出任上海交通大学芯片与系统研究中心主任，开始主持研发汉芯系列DSP芯片。
2003年2月，陈进正式发布“汉芯1号”。随后，芯片得到多名院士以及以及“863计划”集成电路专项小组组成的鉴定专家组的一致认可。
陈进借此申请了多项专利，并借此当上了上海交大微电子学院院长、博导。2004年，他还被聘为长江学者。
而这款在当时被称为国内首创和中国微电子领域里程碑的芯片，也一度成为全中国的骄傲。
当时的报道也将“汉芯一号”推上了行业先锋的高度：“采用国际先进的0.18微米半导体工艺设计，在只有手指指甲一半大小的一个集成块上有250万个器件，而且具有32位运算处理内核，每秒钟可以进行2亿次运算。”
“这一成果接近国际先进技术，在某些方面的性能甚至超过了国外同类产品。”
然而，本来会因此平步青云，甚至有可能问鼎院士头衔的陈进，却在短短几年后瞬间跌落神坛。
2006年1月17日，春节前夕，一位神秘举报人在清华大学BBS上发布的一则神秘帖子——《汉芯黑幕》，彻底打破了中国科技界的一团祥和，其笔锋直抵为中国产业界骄傲的“汉芯”系列芯片发明人——陈进。
