“水陆机动团”作战能力目前存在不少短板
不过，虽然号称“日本版海军陆战队”，但无论从主战装备的配置，还是从战斗支援保障来看，“水陆机动团”与美国海军陆战队相差甚远，其作战能力目前也存在重大系统缺项。
从主战装备配置来看，“水陆机动团”的主战装备尚未到位，实际运行还存在困难。日本防卫省从美国引进的AAV7型两栖突击车2018年3月底前仅交货15辆，另外15辆需今年7月底才能到位。此外，MV-22“鱼鹰”倾转旋翼运输机因发生坠入民宅事故，原本部署在佐贺机场的计划泡汤，目前只能暂时部署在距离“水陆机动团”驻地1000公里外的千叶县木更津陆上自卫队驻地，正式部署地点及时间尚未确定。
从战斗支援保障角度来看，“水陆机动团”存在远程投送能力不足、登陆支援火力缺乏、岸滩工程保障缺失等致命问题，严重制约其两栖作战能力的发挥。
日本海上自卫队目前只有3艘“大隅”级运输舰，每艘只能投送1个营约330人及相应装备，即便把“日向”级或“出云”级直升机护卫舰加入投送序列，也仅能投送一个联队及其附属部队。另外，3艘“大隅”级登陆舰只能搭载6艘气垫登陆艇和2艘普通登陆艇，而一场营级规模登陆战往往需要12艘重型气垫登陆艇和20～24艘普通登陆艇。
