还有一类任务，就是对水声信号进行侦察。所谓水声信号是指潜艇、水面舰艇、大型船舶、鱼雷等在水中航行时发出的噪音信号，每一艘潜艇、舰艇都有不同的噪音特征，侦察、记录这些信号特征，等于给每一艘潜艇、舰艇建立了一个水声信号档案，这些信号如果装到对方的潜艇、舰艇、声纳、鱼雷、智能水雷等兵器中去，就会对我方潜艇和舰艇造成致命的损伤。
如果没有这些水声信号，在茫茫大海中要想发现一艘潜艇真的是大海捞针;如果知道了这些信号，则是有的放矢，直击要害。EP-3侦察机类型繁多，此次迫降在海南的这架飞机，主要是以电子侦察为主，照相和水声侦察的功能较差。
这种具有极大的空中持续巡航能力，具备强大的空中侦察和监视能力的飞机通常都会被认为与间谍、谍报之类的任务联系在一起，它经常在中国沿海空域进行侦察，难道是为了和平、旅游和观光之类的目的？如果不是，那就是非常危险的谍报、间谍或军事侦察活动。
