事实上，北京飞控中心的科技人员对风险有一种高度的警惕，他们花在风险控制上的时间要远远多于正常任务的时间。
从“神舟二号”任务开始，李剑带领课题组开发出“天地一体化飞行控制验证体制”，在任务实施前，用正样飞船、航天员乘组、实战软件和真实测控设备进行验证，相当于把天上的任务先在地上演练一遍，把问题发现、解决在地面。
据李剑介绍，总体室的小伙子高宇辉用近8年时间研发了一套航天器故障诊断系统，能够准确预判航天器故障和参数越界现象。“只要一告警，值班人员就会注意故障，大大提高了人对航天器的掌控能力”。
在李剑看来，“神舟一号”任务和交会对接任务是北京飞控中心技术攻关最艰难的两个时期，也是风险管控压力最大的两个时期。
2012年6月18日，“神舟九号”与“天宫一号”进行首次载人交会对接。载人交会对接飞控事件密集，每一次控制都会有风险。
控制是根据协同工作程序实施的。传统的协同程序编排依靠人工，“加在一起上百万字”，不仅容易出错，而且无法进行动态调整。
