这个提议虽然得到了认同，但出征西北，收复新疆，不是一件容易的事情。阿古柏在新疆盘踞多年，根基深厚，背后又有俄国人跟英国人的支持。而收复伊犁，则需要直面俄国人的挑战。这是一个大难题。
左宗棠清楚其中的难度。他清楚的划分好进攻的主次，把实力较弱的阿古柏作为最先进攻的对象。因为是远征，他没有着急出兵，而是选择养精蓄锐，争取做到速战速决。
从人员，粮草、武器，左宗棠都做到了一次升级。左宗棠砍掉了大批无用、怯战的人员，从而节省下的开支投入到粮草和武器上。尤其是武器，左宗棠当时积极的向国外购买大批先进的武器，又在国内开设了兰州制造局仿造外国武器。
至于在筹钱上，左宗棠把这件事交给了经商高手胡雪岩，让他去办理。效果还算不错。
在出征的时候，左宗棠在大漠沿途的路边种上了许多杨树、柳树和枣树。既是防范风沙，也可以让后来的行人有一个遮风挡雨的地方。
公元1876年4月，左宗棠下令祭旗，出军。最开始的时候，战争打的还算顺利。阿古柏的军队不管在训练，或者装备上，都逊色于左宗棠麾下的军队，常常打败阵。
