日本从上世纪80年代末开始部署PAC-2导弹。进入21世纪后，以加强应对“朝鲜导弹威胁”为由，日本引进并部署具备更强导弹拦截能力的PAC-3导弹。按照日媒报道，日本部署的PAC-3系统分布在关东、九州、北海道等地区，其中在冲绳县的那霸基地和知念基地也有部署。
面向西南方向的冲绳原本并非计划中的部署区域，但日本却提前做出部署。根据“临时防卫需要”，还会对以上部队进行部署调动。如此前朝鲜试射导弹时，自卫队将附近基地的导弹直接调动到首都圈核心地区。
按照日本媒体的说法，日本过去在靠近东京的千叶县和埼玉县部署有4套PAC-3系统，每次朝鲜试射导弹前，日本都会临时性地将PAC-3系统部署到东京市中心的防卫省大院内。
为强化首都防卫，日本才在东京市中心建永久反导阵地。不可否认，日本国内部分舆论对朝鲜的军事能力十分警惕甚至恐惧，这给部署和升级反导系统找到了借口。
