大部分示威者向亚皆老街退去。凌晨2时，人群在亚皆老街和上海街口聚集。数十名示威者在亚皆老街追打约十名警员，同时不断向警员抛掷木卡板及垃圾桶等杂物，警员一边向后退，一边以胡椒喷雾及警棍还击。但由于地上有大量杂物，有警员被地上杂物绊倒。
凌晨2时03分，一名交通警向天开两枪示警，并以枪指向示威者。
现场图
警务处处长卢伟聪指，当时暴徒以硬物袭击一名警员，威胁到该名警员的生命，该名警员摔倒在地，但仍受到暴徒的持续袭击，在别无选择之下，另一名警员根据武器使用守则开枪，以防止他的同事受到进一步的袭击，这也是为了保护他自身的安全。
但这次枪响引发了大规模的恐慌，现场陷入混乱。示威者停止行动并退后。
对峙的地点又转移到弥敦道，有示威者在向警员投掷垃圾桶，被警察用警棍打伤头部，警方一度拉起封锁线，禁止市民走出马路。
凌晨3时40分，香港电台及香港独立媒体报道，示威者开始向警察投掷砖头及玻璃瓶，警察以长盾及警棍驱赶群众，并多次使用胡椒喷雾。
在混乱中，明报记者和无线新闻记者分别被警方和示威者攻击。多处道路中心有人纵火，消防处发言人指，在2月9日凌晨共接获22宗旺角区的火警。
纵火现场
凌晨5时，根据有线新闻，一辆安装保护网的警车由登打士街驶至弥敦道、豉油街交界时，被示威者包围，有示威者以砖头击碎车窗，当时车上仍有警员。
过了一个小时，警方特别战术小队终于赶到现场，并封锁登打士街。期间，有示威者再向警员掷砖头，警员施放催泪水剂，部分示威者四散，多人被捕。
