2003年非典,一开始,中医战疫是很不被重视的,前期没有中医参与的非*典战疫,死亡率很高,根本没有好的治疗办法。后来,吕老邓老等人上书国家领导人,呼吁用中医药来抗击非典,救民于危难,并附上中医药解决非*典的调研报告,这才让中医介入了非*典的治疗。当年,广州是非*典主要疫区,时年88岁的邓老带领他的中医团队奋战在抗疫一线,创造了“四个零”的医学奇迹:“病患零死亡、医护零感染、病患零转院、病患零后遗症”。最让人印象深刻的是,在后来接受媒体采访时,记者问“医护人员怎么预防”时,邓老答:“吃中药,就靠吃中药。所以,不需要靠多少层隔离衣。中医可以用吃中药,来增强身体的抵抗力。我们很潇洒,吃了预防药,戴个口罩就行了。我们第一附属医院病人零死亡。医护人员零感染。”但当时非典庆功宴上没有中医……
2006年,“取消中医”之声再一次出现,对此,邓老曾在一次全国的经方班中,引用了毛主席的诗词:“小小寰球,有几个苍蝇碰壁。嗡嗡叫,几声凄厉,几声抽泣。蚂蚁缘槐夸大国,蚍蜉撼树谈何易。”来抨击这些反对中医的“小丑”。邓老指出,“小丑们”所谓的“万人签名”,确凿之数不过160多人,而广中医一附院一天的门诊量就6000多人次,他们发动全国那么久了才160多人签名,与信任中医、来我们医院看病的人数比较,也就太少得可怜了吧?
与此同时,对于中医药事业本身该如何发展,邓老也提出了很多真知灼见的观点并付诸行动。邓老曾提出:培养“铁杆中医,以振兴中医”。2000年左右,面对全国中医传承“青黄不接”的困局,邓老跟时任广东省中医院院长的吕玉波商定,带头示范,号召全国名老中医打破门户之见,集中到广东省中医院带徒,全力打造一个“铁杆中医的黄埔军校”。这一举措,在全国中医药界产生了深远的影响。