毛主席对于此种状况十分不满。1954年毛主席曾说，解放后卫生部门对中医中药抱有严重的粗暴的宗派主义态度。
1955年4月15日，毛主席进一步批评卫生部门不重视中医工作，他严厉地说：“我可以当卫生部长，也可以把这项工作做起来。不要以为我不懂医就不能做，这不是懂不懂医的问题，而是思想问题。”
正是由于毛主席这种强烈的批评，引发了卫生部门的巨大地震。在毛主席的战略规划下，周总理的具体部署之下，实施了一系列的行动。
其一，1954年11月10日，中央人民政府卫生部被改组为中华人民共和国卫生部，第一任部长是李德全（冯玉祥之妻）。
其二，在卫生部之内设立中医司，以抗衡西医。首任司长为薛和昉（颁发司长任命书的日期是1955年4月21日）。薛和昉的资历非常深，在日常工作中足以抗衡西医那些有头有脸的人物。
其三，在毛主席、周总理的支持下，薛和昉主持举办了全国第一届西医学习中医班。后来从这个班级毕业的许多西医人员都入选为全国的名老中医。（这实际是用中医改造西医的一项计划，与余云岫提出的用西医改造中医针锋相对。）
其四、薛和昉主持创办了四所中医大学（北京、上海、成都、广州）。以此在人才的培养上与西医抗衡。
其五、薛和昉积极在北京地区，甚至奔走全国，与中医交朋友，并延聘大量优秀中医到北京工作。其中包括民国四大中医中的两位：萧龙友、施今墨。一时间，中医司辖下，可谓人才济济。
其六、以名老中医为人才基础，1955年建立了卫生部中医研究院。1971年，该院与北京中医学院合并，更名为中国中医研究院。2005年又更名为中国中医科学院。这样，就使中医在学术上能够与西医抗衡。
2020年，防治新冠病毒中医方剂的甄选，就是由中国中医科学院主持的。葛又文的脱颖而出，与中国中医科学院密切相关。
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