WHO和CDC的建议也许对于其他的呼吸道传染病没问题。但是这次的新冠肺炎百年难遇，他们的专家都没碰到过，也没有相应的防疫经验，还拿那一套去生搬硬套。显然不合适。以至于美国FDA的前任总监都建议普通美国民众戴口罩防疫，但是还是被方舟子嘲笑是抄“罩国”作业。从这里看出方舟子缺少了分析和实践能力，只是一个西方教条的搬运工。
不光认识上错误，方舟子还在行动上错误指导。
居然觉得最大的好处是预防流感，还把流感看的比新冠重。前提条件虽然是疫区，但是中国在过年期间几乎没有一个省不是疫区，现在几乎全球没有一个地方不是疫区。按照他的建议，就是在给国家添乱，传播新冠，对自己和他人生命的不负责。
在武汉进入疫情的攻坚战时，方舟子极尽嘲讽之能事，对政府做的几乎每一项工作都极力鞭笞。尤其是方舱医院，斥之为不顾病人死活。说“更合适的做法是让轻症病人在家隔离”。这又表露出方舟子只知照搬西方经验，枉顾中国国情。在欧美，大部分家庭都是大House，病人可以在单独的房间里，不容易传染给家人，和邻居更是离着老远。
而在中国，大部分人居住在高楼的公寓，花园房或贫民窟，人口密度很大，共用电梯，楼梯，花园，甚至洗手间，澡堂等设施。这种情况下极易引起感染。比方说2003年香港淘大花园，SARS从几例到300多例，只用了10多天。实践证明，建立方舱医院，把轻症病人都放在方舱医院里，大大的减缓了居家引起的疾病传播。
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