2001年4月开始,王忠林离开工作了17年的政法系统,出任枣庄市峄城区委副书记、副区长、代区长。之后,他历任枣庄市峄城区委副书记、区长,枣庄市市中区委副书记、区长,枣庄市峄城区委书记,滕州市委书记,2007年3月出任枣庄市委常委。
2011年12月,王忠林结束在枣庄27年的任职,前往聊城出任市委副书记、市长。2015年7月,他转任山东省发改委主任、党组书记,在这期间,又先后担任省委全面深化改革领导小组办公室副主任,省区域发展战略推进办公室(山东半岛蓝色经济区建设办公室、省黄河三角洲高效生态经济区建设办公室)主任等职务。
曾紧急接任落马市长
2016年,王忠林的仕途迎来新转变。
当时,在中央反腐 败高压态势下,时任济南市委书记王敏、市长杨鲁豫先后落马。2014年12月,王敏接受调查,时任江西省委常委、南昌市委书记王文涛北上出任济南市委书记。2016年4月,市长杨鲁豫接受调查。同年年11月,王忠林出任济南市委副书记、代市长,后来去“代”转正,出任市长。
2018年3月,王文涛再次北上,接任陆昊,出任黑龙江省省长。同年5月,王忠林接班王文涛,成为济南市委书记,也跻身山东省委常委。
这次王忠林再次出任新职,首次跨省前往湖北任职。